Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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TUBB3Q13509 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TUBB3Q13509 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TUBB3Q13509 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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