Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD4Q13485 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms