Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTK7Q13308 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms