Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALCOCO2Q13137 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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