Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms