Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms