Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms