Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms