Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC108125.1-201ENST00000622310 543 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC107058.1-201ENST00000513297 1384 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FKBP1A-202ENST00000381719 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PTPN20-215ENST00000505814 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 EAF1-AS1-205ENST00000595975 892 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC046158.4-201ENST00000623121 1347 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AMELY-201ENST00000215479 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms