Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms