Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD83Q01151 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD83Q01151 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD83Q01151 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD83Q01151 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD83Q01151 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD83Q01151 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD83Q01151 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD83Q01151 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD83Q01151 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CD83Q01151 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CD83Q01151 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms