Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK16Q00536 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms