Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms