Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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