Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX1P83916 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX1P83916 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms