Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UFM1P61960 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms