Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 681.6 ms