Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP107P57740 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP107P57740 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP107P57740 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms