Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D1P54289 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms