Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms