Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX1P48742 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX1P48742 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX1P48742 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX1P48742 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms