Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4P46934 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms