Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDF5P43026 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDF5P43026 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms