Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NUP62P37198 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NUP62P37198 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NUP62P37198 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms