Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGM1P36871 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGM1P36871 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms