Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD12P35452 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms