Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB3P28472 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms