Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IL3RAP26951 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms