Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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