Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
XBP1P17861 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XBP1P17861 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms