Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CKMT2P17540 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms