Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms