Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms