Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CDH1P12830 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.1 ms