Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI2P10070 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI2P10070 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI2P10070 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI2P10070 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms