Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD2P0DJD1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms