Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ZBED1O96006 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ZBED1O96006 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ZBED1O96006 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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