Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POP4O95707 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POP4O95707 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POP4O95707 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POP4O95707 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POP4O95707 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POP4O95707 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POP4O95707 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POP4O95707 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POP4O95707 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POP4O95707 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POP4O95707 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POP4O95707 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POP4O95707 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POP4O95707 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms