Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JRKO75564 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JRKO75564 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
JRKO75564 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JRKO75564 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JRKO75564 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JRKO75564 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JRKO75564 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JRKO75564 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JRKO75564 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JRKO75564 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JRKO75564 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JRKO75564 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JRKO75564 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JRKO75564 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JRKO75564 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JRKO75564 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JRKO75564 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JRKO75564 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms