Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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HOXC11O43248 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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HOXC11O43248 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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HOXC11O43248 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXC11O43248 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXC11O43248 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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