Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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USP17L12C9JPN9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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USP17L12C9JPN9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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USP17L12C9JPN9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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USP17L12C9JPN9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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USP17L12C9JPN9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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USP17L12C9JPN9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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