Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PATL2C9JE40 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms