Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms