Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA3Q9Y6H8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GJA3Q9Y6H8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA3Q9Y6H8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms