Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDY1Q9Y6F8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDY1Q9Y6F8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDY1Q9Y6F8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDY1Q9Y6F8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDY1Q9Y6F8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDY1Q9Y6F8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDY1Q9Y6F8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDY1Q9Y6F8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDY1Q9Y6F8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDY1Q9Y6F8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDY1Q9Y6F8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDY1Q9Y6F8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms