Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC6Q9Y625 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC6Q9Y625 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC6Q9Y625 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC6Q9Y625 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC6Q9Y625 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC6Q9Y625 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC6Q9Y625 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC6Q9Y625 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC6Q9Y625 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC6Q9Y625 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC6Q9Y625 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC6Q9Y625 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms