Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2E3Q9Y5X4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2E3Q9Y5X4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2E3Q9Y5X4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2E3Q9Y5X4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E3Q9Y5X4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E3Q9Y5X4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E3Q9Y5X4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E3Q9Y5X4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E3Q9Y5X4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2E3Q9Y5X4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2E3Q9Y5X4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E3Q9Y5X4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E3Q9Y5X4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms