Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PHLDA3Q9Y5J5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PHLDA3Q9Y5J5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms