Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCAF1Q9Y4C2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF1Q9Y4C2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms