Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
RAD54L2Q9Y4B4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
RAD54L2Q9Y4B4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
RAD54L2Q9Y4B4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
RAD54L2Q9Y4B4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
RAD54L2Q9Y4B4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
RAD54L2Q9Y4B4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
RAD54L2Q9Y4B4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC39.5■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RAD54L2Q9Y4B4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC39.38■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
RAD54L2Q9Y4B4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
RAD54L2Q9Y4B4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms